Los Caballeros del Zodiaco: La Leyenda del Santuario narra la historia de cinco jóvenes guerreros conocidos como los Caballeros de Bronce (Seiya, Shiryu, Shun, Hyoga e Ikki). Su misión es proteger a Saori Kido, una joven dotada de poderes misteriosos que resulta ser la reencarnación de la diosa Atenea. Cuando ella es atacada por una flecha mágica, estos valientes santos deben atravesar, en un plazo de doce horas, los doce Templos del Zodiaco en el Santuario de Atenea, cada uno guardado por un Caballero de Oro. Una vez que lleguen al Santuario, tendrán que enfrentarse al Patriarca y obtener el antídoto que salve a Atenea de una muerte inminente.