Ido, un médico compasivo especializado en cíborgs, se topa con Alita, quien ha sido abandonada en un vertedero de Iron City. Cuando Alita recupera la conciencia, se encuentra desorientada, sin recordar su identidad ni el entorno que la rodea; todo es completamente nuevo para ella. Ido se dedicará a protegerla de su enigmático pasado, mientras que su amigo Hugo la ayudará a recuperar sus recuerdos. En ese proceso, Alita se da cuenta de que posee habilidades extraordinarias en el combate, las cuales podría utilizar para proteger a sus nuevos seres queridos. Decidida a desentrañar la verdad sobre sus orígenes, Alita emprende una travesía que la confrontará con las injusticias de un mundo sombrío y corrupto, descubriendo que solo ella tiene el poder para transformarlo.
